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求解蛋白质结构预测问题的二维连续模型及其相应的拟物算法

作者:黄文奇; 黄勤波; 石赫蛋白质结构预测np难度问题折叠拟物算法引力势能

摘要:研究了生物信息学中的一个重要问题,即蛋白质结构预测.受物理世界的物体间相互作用的规律的启发,给出了该问题一个二维欧氏空间连续模型.它比离散模型有一定的优越性,此模型的优点可能在于让计算很自然地利用到了一个客观存在的'天然导引',这个'天然导引'即是疏水氨基酸之间的引力,从而在构形优度相当的前提下,连续模型有助于计算速度的提高.然后根据这个连续模型找到了相应的拟物算法,最后给出了一些实验结果,它们也说明了这个连续模型及相应的拟物算法的优点.

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计算机研究与发展

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