作者:黄志洪 吕威 黄俊序列比对blast算法位图索引
摘要:针对BLAST算法在查找命中的过程中需要遍历数据库造成计算资源消耗的问题,提出了基于位图索引和B+树的数据存储方式以加快数据的检索。改进算法利用位图索引的原理建立数据库的单词.位向量表,并对这个表使用B+树再次进行索引,最终达到加快BLAST程序的运算速度。对于DNA序列这个方法能够使BLAST查找命中耗费的时间得到极大的减少。
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《计算机工程与应用》(CN:11-2127/TP)是一本有较高学术价值的大型半月刊,自创刊以来,选题新奇而不失报道广度,服务大众而不失理论高度。颇受业界和广大读者的关注和好评。
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