超级多重基因组序列比对算法

作者：呼广跃; 沈世镒多重序列比对后缀树锚定

摘要：大量同源的长基因组序列的多重比对需要高效率的比对算法.论文开发出一个新的比对工具“超级多重基因组比对”（简称SMGA）,该系统是建立在序列突变与比对的“模代数”理论基础上专为长基因组序列的多重比对设计的.SMGA在一台主频2.8G的PC机上完成平均长度约5M的9条有机菌基因组的多重比对的时间大约为35min.论文还使用模拟数据对SMGA的比对精确度做了估计.

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