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一种基于NJ的高效构建系统进化树算法

作者:谭严芳; 金人超系统进化树kimura两参数模型

摘要:在分析和证明了构建进化树的Neighbor-joining算法存在的不足后,提出了一种新的改进算法。算法主要有以下两点改进:采用Kimum两参数模型,根据此模型来计算DNA序列距离,并且定义了新的校正距离。计算机模拟结果表明,改进算法的效率明显地优于NJ算法。

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计算机工程与应用

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