作者：池玉杰; 吴书景; 于存猛过氧化物酶基因生物信息学比对猛离子转录调控荧光定量pcr
摘要：检测了不同浓度的Mn^2+对偏肿革衲菌3个猛过氧化物酶(MnPs)基因Lg-mnpl、2、3在转录水平上的调控作用,为研究MnPs基因的表达调控机制奠定基础。用相关生物信息学方法对基因和蛋白序列进行比对与分析,用qPCR检测了在LNAS培养基内Mn^2+4种不同浓度下(0,40,200,400 μmol/L)3个基因在转录水平上的相对表达量。结果表明:3个Lg-mnps在基因结构上不尽相同,既有较多的相似之处,也存在着差异。在外显子的长度和序列组成、内含子的位置上,Lg-mnpl与Lg-mnp2更一致,而Lg-mnp3与二者一些特征相似、一些不尽相同。系统发育分析表明,Lg-mnpl和Lg-mnp2比Lg-mnp3更接近。3个Lg-mnps基因在转录水平上都受不同浓度的Mn^2+差异调控,在不同浓度的Mn^2+和不同时间条件下的转录水平各不相同,Lg-mnpl的最高转录量是在11 d时200 μmol/L Mn^2+下,为0.043;Lg-mnp2的转录变化曲线与Lg-mnpl相似,但最高转录量是在9 d时200 μmol/L Mn^2+下,为0.929;Lg-mnp3与Lg-mnpl、2不尽相似,最高转录量是在11 d时40 μmol/L Mn^2+下,为0.106。Lg-mnp2的转录水平5 d后几乎在所有浓度Mn^2+条件下都远远高于Lg-mnpl和Lg-mnp3的转录水平。
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