作者:陈二龙; 张明刚; 李成刚; 孙占伟; 杨晓亮...烟草热激蛋白70基因家族生物信息学叶绿体
摘要:以NCBI和SGN数据库为基础,使用生物信息学技术对烟草Hsp70基因家族的成员进行鉴定,且以烟草品种“红花大金元”为材料,运用实时荧光定量PCR法,分析在烟草叶肉内发挥作用的CpHsp70基因成员在高温的逆境环境的表达量。结果表明:烟草含有61个Hsp70基因成员,其理化特性存在差异;染色体定位显示,Hsp70基因分布在18条染龟体中,其中叶绿体成员分布在6、17、19号染色体;系统进化显示,烟草Hsp70基因分布在5组,2亚组,叶绿体成员位于V-A亚组;基因结构显示,内含子数为0~13,叶绿体成员内含子数为7;保守基序显示,Motif在各组之间具有差异,特异性的Motif 16、Motif 17、Motif 20位于I组的细胞质成员中,M otif2、Motif 5属于ID组细胞质和IV组内质网成员中,Motif 15和Motif 19存在V-A亚组叶绿体成员中;实时荧光定量PCR分析呈现,NtCpHsp70基因不易受高温诱导。综上,烟草Hsp70功能结构具有多样性,而NtCpHsp70基因表达受烘烤环境的影响较小。
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