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多囊卵巢综合征患者与正常排卵妇女GV期卵母细胞转录组的比较

作者:杜琛; 陈秀娟; 侯石磊; 赵杰多囊卵巢综合征控制性卵巢刺激卵母细胞高通量测序

摘要:目的:探讨控制性卵巢刺激(COS)对多囊卵巢综合征(PCOS)患者和正常排卵妇女GV期卵母细胞中差异表达基因和主要信号转导通路的影响,从而筛选出影响PCOS患者卵母细胞发育的关键基因。方法:选择接受GnRH-a长方案将调的控制性超排卵的PCOS患者3例(PCOS组)和同期因男性不孕因素接受长方案将调的正常排卵妇女3人(对照组),通过酶消化法分离颗粒细胞,收集经过卵胞浆内单精子显微注射(ICSI)之后废弃的未成熟卵母细胞。构建cDNA文库,在Illumina MiSeq测序平台进行测序,并通过RT-PCR技术对测序数据进行体外验证(每组3个重复)。结果:获得了510 024 82个序列读取片段(reads),包含8G碱基序列信息。通过生物信息学软件共找到63个差异表达基因,极显著上调的基因19个,极显著下调基因有44个(Fold Change〉4,FDR〈0.01)。PCOS组患者血管内皮生长因子(VEGF)和脂肪酸脱氢酶1(FADS1)mRNA表达水平明显高于对照组(P〈0.05),Runt相关转录因子2(RUNX2)、趋化因子1(CXCL1)和热体克蛋白27(Hsp27)mRNA表达水平明显低于对照组(P〈0.05),与功能验证结果一致。差异基因基于GO功能注释可分为磷酰化、细胞自噬和转录调控等多个分支,利用KEGG数据库作为参考,这些基因主要富集于磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)、转化生长因子β(TGF-β)、Hippo、p53和过氧化物酶体增殖剂激活受体(PPAR)信号通路中。结论:PCOS患者GV期卵母细胞中差异表达的基因可能影响卵泡发育和卵母细胞成熟,从而导致胚胎质量低下。

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吉林大学学报·信息科学版

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