作者：傅建敏; 索玉静; 刘慧敏; 谭晓风柿属植物叶绿体密码子偏好性最优密码子
摘要：为给后续柿属植物叶绿体基因工程研究提供基础，利用CodonW、CUSP、SPSS软件对5个柿属植物叶绿体基因组中的55条蛋白质编码基因序列进行密码子使用模式分析。结果显示，柿属植物叶绿体基因组密码子第3位碱基GC含量为26.9％～27．8％，有效密码子数在49．58～50．18之间，密码子偏好性较弱；柿叶绿体基因组不同位置的有效密码子数不同，取值范围为32．36～59．64；中性绘图分析和ENC-plot绘图分析结果表明，柿叶绿体基因组的密码子偏好性主要受选择的影响；通过高频密码子和高表达优越密码子分析相结合的方法，筛选出23个柿属植物最优密码子，且这些密码子主要以A和U碱基结尾。
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