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鳜属3个物种的遗传多样性分析

作者:吴晓蕙; 梁旭方; 何珊翘嘴鳜大眼鳜斑鳜微卫星遗传多态性野生物种

摘要:本研究在实验室已有的转录组结果的基础上,从测序结果中随机选出部分微卫星位点进行多态性研究,并利用其中25个具有多态性的SSR(simple sequence repeat)位点,对3个鳜属物种斑鳜、翘嘴鳜和大眼鳜进行遗传多样性研究,分析其遗传结构和亲缘关系.实验结果显示,在3个野生物种中共检测到324个等位基因;每对引物检测到的等位基因数为3~23个;平均等位基因数为12.96个.其中共有21个位点属高度多态位点,其平均观测杂合度为0.5234,平均期望杂合度是0.7944,平均多态信息含量为0.7010,这表明3个物种在各检测位点中具有较好的多态性.对数据进行F-检测,25个微卫星位点的Fst值为0.0400~0.6340,平均Fst值是0.2000,说明3个鳜属群体间的分化程度存在差异,在部分位点处,分化程度较高.斑鳜和大眼鳜间Nei氏遗传距离最大,为1.7734;翘嘴鳜和大眼鳜的遗传距离最小,为0.3714.根据遗传距离进行的UPMEGA法聚类分析显示翘嘴鳜和大眼鳜聚为一支,斑鳜独自为一支.

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暨南大学学报·自然科学与医学版

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