作者：宋冰; 任战军; 宫瑞光; 孟繁臣肉兔野兔盲肠菌群多样性菌群结构
摘要：论文旨在分析工厂兔、散养兔和野兔的盲肠菌群多样性及菌群结构。收集工厂兔、散养兔和野兔各6只并采集盲肠内容物,提取盲肠内容物基因组DNA并对16SrDNA的V4-V5区进行HiSeq测序。结果表明：（1）工厂兔盲肠细菌种类数、盲肠菌群丰富度、盲肠菌群多样性指数均显著（P〈0.05）高于散养兔和野兔。（2）工厂兔、散养兔和野兔盲肠菌群结构相互之间差异显著（P〈0.05）。（3）工厂兔、散养兔和野兔盲肠菌群的主要菌门为厚壁菌门（工厂兔为71.54%,散养兔为65.37%,野兔为63.25%）、拟杆菌门（工厂兔为23.78%,散养兔为30.8%,野兔为21.21%）,野兔的特殊优势菌门为螺旋体门（12.36%）。工厂兔、散养兔和野兔盲肠菌群的主要菌科均含瘤胃菌科（工厂兔为39.26%,散养兔为33.33%,野兔为29.16%）、毛螺菌科（工厂兔为23.04%,散养兔为28.47%,野兔为21.54%）,散养兔的特殊优势菌科为理研菌科（19.75%）,野兔的特殊优势菌科为螺旋体科（12.36%）。在属水平上,工厂兔、散养兔和野兔盲肠菌群丰度最高的分别为拟杆菌属（9.45%）、理研菌科-RC9-gut-group（17.68%）、Sphaerochaeta（12.36%）。综上,工厂兔、散养兔和野兔盲肠菌群结构差异显著（P〈0.05）,但主要菌门均为厚壁菌门和拟杆菌门;工厂兔盲肠菌群多样性高于散养兔和野兔。
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