作者:杨辉; 艾闽; 李锋刚; 刘小林; 王立新大鲵生物信息学分析组织表达
摘要:从大鲵皮肤cDNA文库中分离获得大鲵α1-血红蛋白基因全长cDNA序列,生物信息学分析表明,大鲵α1-血红蛋白基因全长cDNA序列为594bp,开放阅读框共432bp,编码144个氨基酸,编码的大鲵α1-血红蛋白推测的理论分子量为16.05kDa,等电点为6.44。氨基酸组成中酸性氨基酸11.9%,中性氨基酸69.99/6,碱性氨基酸18.2%。结构分析表明,该蛋白没有信号肽,但在100~122个氨基酸处以及98~122个氨基酸处分别有由里向外、由外向里的跨膜螺旋区,二级结构以α-螺旋为主。氨基酸序进行同源性列比对表明与人、猕猴的亲缘关系最近,和牛蛙的亲缘关系最低只有35%。荧光定量PCR结果表明,α1-血红蛋白基因在肌肉中表达量最高,在胃中最低。
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