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裂谷热病毒流行特征及遗传进化分析

作者:赖丽金; 尚翠; 韦艳; 李建东裂谷热病毒裂谷热流行病学特征遗传进化传播途径跨境传播非洲

摘要:目的分析裂谷热病毒自发现以来,疫情发生、疫源地分布以及病毒遗传进化和流行特征,为科学防控提供依据。方法应用描述性流行病学方法收集、分析裂谷热疫情的流行情况,筛选全球有明确分离时间和地区的病毒的全基因组序列,利用BEAST 2等软件进行系统进化分析。结果截止2018年,全球共22个国家报告了裂谷热本地疫情,人间报告病例39 404例,死亡病例2 323例。共筛选出183条S片段、138条M片段和135条L片段基因序列。系统进化树显示,裂谷热病毒的S、M和L片段可分为7个基因亚型(A~G),A亚型和B亚型是引起3次大流行的主要亚型。2016年中国发现首例输入性病例,国际跨境传播趋势有所增强。结论裂谷热病毒在非洲分布范围广,实际流行形势被明显低估,应加强对该病毒的监测,注重信息收集与,提高有关部门和群众的防控意识,保护公民健康。

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