作者：乔洪金 刘相全 孙国华 房景辉 韦秀梅 张...大竹蛏微卫星表达序列标签等位基因
摘要：利用微卫星查找软件SSRIT对大竹蛏cDNA文库（2038条EST）中2—6个碱基重复单元组成的简单序列重复进行了筛选。最少重复次数设定为5次，共发现包含微卫星位点的EST96条，占整个EST数据库的4．71％；共发现微卫星位点103个，其中含双碱基重复序列77个，数量最多，占总数的74．76％；三、四碱基重复序列分别占微卫星序列总数的22．33％、2．91％，没有发现五或六碱基的重复。对含有SSR位点符合微卫星引物设计的EST序列，利用在线引物设计软件Primer3设计合成引物14对，以南通野生群体为模板PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳发现，其中5对有多态性位点。在5个微卫星位点上，等位基因的数目从2—7个不等，观测杂合度和期望杂合度分别为0．067—1．000和0．066—0．775，香农指数在0．146—1．545之间。结果表明，所筛选的微卫星标记可用于遗传分析。
注：因版权方要求，不能公开全文，如需全文，请咨询杂志社
