作者：高焕; 刘萍; 孟宪红; 王伟继; 孔杰微卫星中国对虾基因组
摘要：对中国对虾基因组随机测序,获得了总长度约为641000个碱基的基因组DNA序列,从中找到1362个重复序列.其中,两碱基重复类型的重复数目最多(985个),占重复序列总数目的72.32%;其次是三碱基(149个)和四碱基(102个),分别占重复序列总数目的10.94%和7.49%.另外,六碱基重复34个,单碱基重复50个,五碱基重复5个,分别占重复序列总数目的2.50%、3.67%、0.37%.在单碱基重复类型中,重复拷贝类别为A的重复数目最多;两碱基重复类型中,AT重复数目最多,其次是AC和AG;三碱基重复类型中以AAT重复拷贝类别最多,其次是AAG和ATC;四碱基重复类型中,AGAT重复数目最多;五碱基重复类型只发现了AGAGA、GAGGC、TCTTC和TTTCT四种重复拷贝类别;六碱基重复中以ATTATC重复数目最多.其中一些序列已经提交GeneBank注册,注册号为AY545898-AY545913.中国对虾基因组二碱基重复类型中以不完全(Imperfect)形式的微卫星序列为主,其中GC重复拷贝类别的重复数目很少.利用8对微卫星引物对60个个体遗传多样性分析,共获得了60个等位基因,因此认为微卫星技术在中国对虾基因组研究中具有较好的应用前景.
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