作者：沈朕; 关洪斌; 郑风荣; 胡发文; 郭文; 王...大泷六线鱼野生和养殖群体遗传多样性
摘要：利用线粒体DNA的细胞色素b（cytb）和控制区（D-loop）的部分序列来研究大泷六线鱼4个群体（包括野生和养殖群体）的遗传多样性。PCR扩增后分别得到365bp（cytb）和387bp（D-loop）的碱基序列。Mega计算结果显示cytb中A＋T的含量（52.6%）高于G＋C的含量（47.3%）;D-loop中A＋T的含量（69.3%）同样高于G＋C的含量（30.7%）。4个群体平均的变异位点、单倍型数、单倍型多样性、核苷酸多样性及平均核苷酸差异数,cytb基因分别为10,7.75,0.739,0.007 3和2.656;D-loop区分别为18.25,12.75,0.846,0.012 1和4.673。4个群体的遗传多样性由高到低分别为舟山、大连、琅琊台、即墨养殖群体,养殖群体的多样性低于野生群体。基于野生群体cytb和D-loop的分子变异分析（AMOVA）得出的Fst分别为0.318 6和0.271 4,显示了变异主要发生在群体内部。基于Kimura 2-parameter模型构建的NJ树结果表明3个野生群体间没有显著的分化。线粒体cytb基因和D-loop区均可作为检测大泷六线鱼遗传多样性的有效标记。
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