镉胁迫下西瓜的转录组测序分析

作者：王志伟; 李涵; 邹甜; 孙波; 孙小武西瓜镉胁迫转录组差异基因高通量测序

摘要：以西瓜品种和欣（HX）和黑媚娘（HMN）的幼苗叶片为材料，经60 mg/kg氯化镉溶液处理（以未经氯化镉溶液处理的为对照）后，采用 Illumina 测序技术对转录组进行高通量测序，探讨西瓜镉胁迫的分子机理。结果表明：在黑媚娘处理组（HMN）和对照组（HMNCK）中共检测到8 579条差异基因，其中有4 297条基因表达显著上调，4 282条基因表达明显下调；在和欣处理组（HX）和对照组（HXCK）中共检测到7 108条差异基因，其中有3 662条基因表达显著上调，3 446条基因表达显著下调；不同组间差异基因的维恩图表明，HMN和HX组间有5 656条差异基因；根据不同数据库的注释信息，发现西瓜体内与镉胁迫相关的差异表达基因主要包括响应光合作用、信号转导、次生物质代谢、转录因子等相关基因；转录因子MYB、AP2/EREBP、bHLH、NAC 和WRKY家族可能在西瓜响应镉胁迫中具有重要作用。用 qRT–PCR 技术对随机挑选的7条基因进行荧光定量验证，结果与Illumina测序数据一致，证实了差异表达基因数据的有效性。

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