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首页 期刊 湖北林业科技 杜鹃花表达序列标签资源中的微卫星信息分析【正文】

杜鹃花表达序列标签资源中的微卫星信息分析

作者:王书珍 张传进 程华 方元平 项俊 郑永良 ...杜鹃花微卫星表达序列标签遗传多样性

摘要:从NCBI数据库下载杜鹃花表达序列标签序列1323条,去冗余后得到912条EST。采用Tandemrepeatfinder软件分析,最终在61条EST序列中找到65个SSR位点,出现频率为7.1272%。二碱基重复是杜鹃花EST内SSR的主要重复类型,占66.1538%;单碱基和三碱基重复次之,分别占据15.3846%和9.2308%。四碱基、五碱基、六碱基类型的SSR相对比较少。多达90.7692%的SSR位点为完美型微卫星重复。这些富含SSR位点的EST序列将为开发微卫星特异性引物,并用于杜鹃花群体生物多样性和遗传结构分析提供理论依据。

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湖北林业科技

《湖北林业科技》(CN:42-1175/S)是一本有较高学术价值的大型双月刊,自创刊以来,选题新奇而不失报道广度,服务大众而不失理论高度。颇受业界和广大读者的关注和好评。 《湖北林业科技》始终以“两个面向”,即“ 面向林业科技制高点,面向林业生产第一线”为宗旨,在林业科技向现实生产力的转化过程中起着越来越重要的作用,并逐步成为林业科技的宣传中心、企事业单位自我展示的园地、人才培养的摇篮。

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