作者：马秀丽 宋敏训 于可响 廖明 辛朝安分离株基因组测序基因组分析
摘要：对我国鸭病毒性肝炎病毒（Duck hepatitis virus，DHV）分离株YZ和cL的全基因组进行了序列测定分析．结果表明，2分离株的基因组全长分别为7713nt和7709nt，包括626nt的5’UTR、6747nt的ORF、314nt的3’UTR以及23nt和19nt的poly（A）尾．结构蛋白VP0含有保守的四肽CPRP，VP3的N端存在一段约20个氨基酸的碱性氨基酸富集区域；VP1缺少RGD（Arg—Gly—Asp）基序．DHV2分离株存在3个不相关的2A蛋白基序，其中2A1蛋白类似口蹄疫病毒属的2A蛋白，2A2蛋白与AIG1蛋白（拟南芥）和GTPase更为相似，2A3蛋白则与副肠孤病毒属的2A2蛋白类型相似；2C蛋白含有保守基序EPxxxxxxGxxGxGK（S／T）、QxxxxxDDxxQ和KGxxxxSxxxxxS／T．3C蛋白含有催化三联体H38-D69-C144；3D蛋白包含KDELR、DxxxxD、GxxSGxxxTxxxNx、YGDD和FLKR等RNA聚合酶的特征基序．基于多聚蛋白、VP1、2C和3C蛋白的进化关系分析结果均表明，DHV分离株与副肠孤病毒属的遗传关系最近，但占据一个清晰的独立遗传谱系，应将DHV单独划属．
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