作者：刘洪超; 史康克; 张雨; 魏志豪微小rnas多形性胶质母细胞瘤生物信息学细胞粘附细胞骨架信号通路
摘要：目的筛选多形性胶质母细胞瘤(glioblastoma multiforme,GBM)相关的miRNAs并进行生物信息学分析。方法从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载芯片数据集GSE65626,采用BRB-Array Tools鉴定差异表达miRNAs。利用miRanda和TargetScan在线工具预测差异表达miRNAs的靶基因,然后对靶基因进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和通路富集分析,并构建miRNA-Gene互作网络。结果从GBM组织和瘤旁组织之间共筛选出128个差异表达miRNAs,其中61个上调表达,67个下调表达。GO功能富集分析表明差异表达miRNAs的靶基因主要涉及转录调控、信号传导、轴突导向、细胞粘附、细胞增殖与凋亡调控等生物过程。通路富集分析发现靶基因显著富集于磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol-3-kinase,PI3K)-Akt信号通路、粘着斑、细胞骨架调节、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路、轴突导向等通路。miRNA-Gene互作网络分析鉴定的核心miRNAs有hsa-miR-106b-5p、hsa-miR-195-5p、hsa-miR-5001-5p、hsa-miR-27a-3p、hsa-miR-130a-3p。结论 miRNAs表达异常在人类GBM中发挥着重要作用,为阐明miRNAs在GBM发生发展过程中的分子机制以及开发靶向治疗提供基础。
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