作者：田伟; 刘伟; 张伟; 邹本革黑凤鸡基因克隆序列分析同源性二级结构
摘要：为进行黑凤鸡α干扰素(ChIFN-α)基因克隆与序列分析研究,笔者利用RT-PCR技术扩增黑凤鸡肝脏ChIFN-α基因,将其连接到pUCm-T载体上进行遗传转化,对重组子进行序列测定,同时利用ExPASy、BLAST、DNAStar等软件对ChIFN-α进行序列分析。结果表明:ChIFN-α基因长度为582 bp,编码193个氨基酸,分子质量为22. 116 ku,等电点为9. 06;ChIFN-α与已报道的其他鸡的IFN-α蛋白序列具有较高的同源性,与蓝孔雀首先聚类,其次是鸭、天鹅、雁等,与哺乳动物的亲缘关系较远;ChIFN-α具有干扰素α、β的匹配区域,同时含有其跨膜亚基IFNAR-1和IFNAR-2的结合位点,预测ChIFN-α属于IFαβ超家族;ChIFN-α为分泌蛋白,前31个氨基酸为信号肽序列,不存在跨膜结构;ChIFN-α的二级结构主要以α-螺旋(61. 14%)和无规则卷曲(35. 75%)为主。
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