作者：赵勤涛; 张建华犬zp3生物信息学结构预测生物学功能
摘要：为了进一步研究家犬（Canis lupus familiaris）zP3的生物学功能及作用机制，研究采用生物信息学的方法，从NCBI数据库中搜集犬zP3基因的编码区序列（CDS），通过MAGE软件将其转化为蛋白质序列，利用ExPASy、BLAST和DNAStar等生物信息学在线软件及程序对蛋白质的一级、二级和三级结构进行预测，运用PAML软件对11个物种zP3基因进化、受到选择的位点进行分析，用Predict-protein和Weblogo分析了ZP3的保守性，采用Python和PyMOL对蛋白质的三级结构进行编辑。结果表明：犬zP3基因编码426个氨基酸，编码产物是一个有信号肽的亲水跨膜蛋白，第1～23位氨基酸是信号肽区域，跨膜结构域在第386～408位氨基酸的仪螺旋区；有4个位点检测到受到磷酸化的作用，这些磷酸化位点可能与信号转导有关；在zP结构域上有9个蛋白质结合位点；在zP3的325～385区段存在1个高变异区，并且大部分的磷酸化和受选择的氨基酸位点都分布在这一区域。说明该区域经历了快速的进化，暗示zP“结构域和该高变异区可能参与了精一卵的相互作用。
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