作者:黄昌力; 魏春娅; 黄震; 张桂红基因组序列分析
摘要:为了给在分子水平上研究鸭肝炎病毒(DHV)的致病机理奠定基础,进一步丰富DHV的遗传变异和进化信息,试验采用RT—PCR方法分段克隆获得DHV—lGD株的全基因组序列并进行序列分析。结果表明:GD株的基因组全长7690nt[不含Poly(A)尾],5’端和3’端非编码区长度分别为626nt和314nt,单一开放阅读框架(ORF)为627—7376nt,编码2249个氨基酸;GD株与DHV-1参考株比较,其核苷酸和氨基酸同源性分别为94.8%-99.7%和97.7%~99.6%;与中国台湾和韩国新型DHV(DHV—N)相比同源性分别为72.7%-73.2%和81.8%~83.4%;GD株与DHV-1参考株遗传进化关系较密切,处于同一分支,而与DHV—N遗传关系较远,处于不同分支。
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