作者：迟莹莹; 栾非时; 李桂英西瓜遗传图谱snpcapsqtl
摘要：利用西瓜基因组重测序数据挖掘SNP位点并将其转变为CAPS标记,构建遗传连锁图谱,对西瓜果实相关性状进行QTL分析。以普通西瓜品系（Citrullus lanatus subsp.vulgaris）花园母本和黏籽西瓜品系（Citrullus lanatus subsp.mucosospermus）PI 186490为亲本,构建BC1群体。对亲本材料进行基因组重测序,覆盖西瓜基因组20×以上,发掘SNP位点,运用SNP2CAPS软件选择7种限制性内切酶对包含SNP位点的序列进行酶切位点分析并将其转化为CAPS标记。筛选具有多态性的CAPS标记,对225株BC1群体内各单株进行基因分型,对西瓜果实相关性状进行QTL分析。在两亲本间共获得SNP位点751 532个,设计CAPS引物450对,筛选出多态性引物200对,贡献率为44.44%。所构建遗传连锁图谱包含11个连锁群（分别对应西瓜基因组的11条染色体）,覆盖基因组长度1 376.95 cm。获得与果实相关性状QTL位点15个。说明西瓜是可溶性固形物,具有果肉硬度、种子百粒重符合的数量性状遗传特点,种皮底色受四个QTL位点控制。
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