作者:邵露营; 周延清; 杨珂; 郭萌萌地黄磷酸丙糖异构酶基因rgtpi基因生物信息学分析空间表达
摘要:在已知地黄磷酸丙糖异构酶(RgTPI)基因少量片段的基础上,采用电子克隆技术克隆出RgTPI基因的完整开放阅读框(ORF),并进行生物信息学分析,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法分析其空间表达模式,为进一步研究其在糖酵解过程中的作用及其他功能的开发应用奠定基础。结果表明,克隆得到的RgTPI基因完整ORF序列全长为765bp,编码254个氨基酸,该序列与芝麻和猴面花等植物中的TPI基因有较高的同源性。经预测发现,RgTPI为稳定的亲水性蛋白,属于ICL-KPHMT超家族的成员。该蛋白中α螺旋占46.06%,无规卷曲占28.35%,延伸链占16.93%,β转角占8.66%,是一种转移酶,没有跨膜运输功能,不是分泌性蛋白,大多存在于线粒体中。qRT-PCR结果表明,RgTPI在地黄叶中的表达量明显高于根和茎。
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