作者：苑振宽; 刘力榕; 海鑫长非编码rna亚型相关药物互作网络生物学功能kegg通路
摘要：目的基于长非编码RNA(lncRNA)及mRNA双重表达谱,构建乳腺癌basal-like亚型相关的lncRNA-mRNA-drug互作网络。方法以乳腺癌basal-like亚型为疾病模型,基于新一代测序技术构建乳腺癌长非编码RNA与编码RNA转录组分子图谱,采用关联有罪的原理识别了basal-like亚型中显著差异改变的lncRNA-mRNA共表达对,进而结合药物及其靶关系构建lncRNA-mRNA-drug互作网络。结果基于RNA-seq数据获得的双重表达谱共识别了1 122个差异表达的lncRNA和6 370个差异表达的mRNA,利用DAVID识别了显著富集的29个生物学功能及8条KEGG通路,最终结合药物及其靶关系构建了非编码RNA介导的乳腺癌亚型相关的药物互作网络。结论基于TCGA的lncRNA及mRNA双重表达谱,从计算系统生物学角度提出了识别乳腺癌basal-like亚型相关风险lncRNA新策略,构建了非编码RNA介导的乳腺癌basal-like亚型相关药物互作网络,为解析乳腺癌basal-like亚型分子机制及药物重定位提供了重要的科学依据。
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