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基于显著表达差异三元组识别缺血性心肌病易感基因

作者:邹宇情; 宋朝娜; 王亚辉; 冯玉炎; 胡二强...缺血性心肌病易感基因三元组分类效能

摘要:目的基于系统生物学理论和生物信息学方法,识别缺血性心肌病(ischemic cardiomyopathy,ICM)易感基因。方法从包含缺血性心肌病和正常样本的测序数据获得各样本的mRNA、miRNA和lncRNA的表达数据,在疾病组和对照组中分别构建显著表达差异三元组,将其中富集到疾病相关功能类中的差异基因作为疾病候选易感基因。进一步将在疾病相关功能类中且单一和组合均能较好区分疾病和正常样本的候选易感基因作为缺血性心肌病易感基因。结果结合高通量基因组信息和功能性分析,识别出了8个缺血性心肌病易感基因,其所在显著表达差异三元组也能够有效地分类样本。结论识别出的缺血性心肌病易感基因有助于缺血性心肌病的诊断、治疗以及疾病机制的研究。

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哈尔滨医科大学学报

《哈尔滨医科大学学报》(CN:23-1159/R)是一本有较高学术价值的双月刊,自创刊以来,选题新奇而不失报道广度,服务大众而不失理论高度。颇受业界和广大读者的关注和好评。 《哈尔滨医科大学学报》主要刊登哈尔滨医科大学教师、研究生、医务人员、科研人员及海内外校友在科研、医疗和边缘学科等领域的研究成果及综述性文章。

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