作者：蔡深文; 徐仲瑞; 熊治廷haichowensis细胞壁转化酶同源建模分子对接
摘要：为研究铜胁迫下海州香薷(Elsholtzia haichowensis Sun)非矿区种群细胞壁转化酶(Eh Ncw INV)和矿区种群细胞壁转化酶(Eh Ccw INV)活性差异的机理,运用在线分析工具对细胞壁转化酶基因推导的氨基酸序列进行分析,利用SWISS-MODEL进行同源建模,并将细胞壁转化酶与蔗糖分子进行模拟对接。结果表明,海州香薷两个种群细胞壁转化酶蛋白质在443位点和538位点处存在氨基酸趋异位点,模拟的3D结构非常相似,仅在趋异位点Leu433/Pro433和Tyr538/His538处有差别。Eh Ncw INV、Eh Ccw INV和模拟突变体(Eh Ncw INV-L433P和Eh Ncw INV-Y538H)与蔗糖分子对接形成的催化活性中心构象基本一致,但在空间位置上存在细微差异,氨基酸趋异可能是造成两个种群细胞壁转化酶活性差异的原因之一。
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