作者：宝力德; 冀锦华; 刘柯澜; 冯福应盐碱湖bchy基因cutoff值otus系统发育分析多样性基因克隆文库
摘要：为进一步了解和认识APB及其在盐碱湖中的生态功能及其作用机制，通过构建和分析不产氧光合细菌bchY基因克隆文库，揭示其中不产氧光合细菌的多样性、群落结构及其与生存环境的关系。样品采自内蒙古浑善达克沙地盐碱度较高的扎格斯台和达格淖2个湖的水样，提取了样品总DNA。以bchY作为检测APB的通用标记，用PCR扩增方法构建了其bchY文库，并对扩增产物进行了测序与系统发育分析。结果表明，达格淖湖和扎各斯台湖均为富营养化盐碱湖，且两湖盐度相差很大。利用bchY文库中核酸序列对应的氨基酸序列进行分析，两文库覆盖度均达93.0%以上，代表性较强，共得到108条bchY编码的氨基酸序列，以cutOff=0.03和0.12分别在种和属水平进行同源性和系统发育分析，在cutoff=0.〇3分为I7个OTUs。两湖的多样性指数（Shannon-Weaver和Simpson)和均勻度指数（Evenness)较接近，其种群多样性程度和均勻程度比较相似，但二者的Chaol都不太高，说明两湖APB的多样性较低，种群不丰富。达格淖湖的Margalei.指数较高，说明前者物种数目比后者多。两湖的不产氧光合细菌均属Alphaproteobacteria纲，最优势菌群均为eZ佩尽如疆。同源性及系统发育性分析表明，达格掉湖和扎各斯台湖中不产氧光合细菌的主要类型为AAPB-like类群、多样性低。
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