作者：宋莎; 冯建文; 吴亚维; 罗昌国; 韩秀梅花红ssr标记贵州云南
摘要：为花红新型分子标记引物的筛选提供序列参考,采用RAD-seq(restriction-site associated DNA sequencing)技术对收集的10份花红(Malus asiatica Nakai.)样品进行简化基因组测序、聚类分析等种质鉴定。结果表明:10个样品共获得13 976 968 360个原始数据(Clean date),过滤后高质量的原始数据占总量的98.18%;经序列分析获得SSR位点40 623个,成功设计SSR引物37 141对,设计率为91.43%,其中以二核苷酸重复基序最为丰富,占总位点数的68.10%;10对备选SSR引物中筛选出可在花红中成功扩增并表现出多态性的引物有7对;聚类分析可有效区分出10份花红资源,并能将贵州省的8份资源和云南省的2份资源区分开。
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