作者：李艳红; 曾卫军; 李金玉; 葛风伟; 朱艳蕾...独行菜laap2基因克隆序列分析表达分析低温耐受分子生物学
摘要：AP2/ERF是广泛存在于植物中一类重要的转录因子,调控一些参与非生物胁迫相关基因的表达,帮助植物提高逆境胁迫能力.为了深入探讨LaAP2在独行菜耐受低温萌发及幼苗耐受低温生长中的功能,该研究基于前期对独行菜（Lepidiumapetalum）转录组数据库分析,克隆获得一个显著上调表达的AP2/ERF家族序列LaAP2.该基因cDNA全长为1005bp,编码氨基酸序列包含一个AP2和一个B3结构域,属于AP2/ERF转录因子RAV亚家族.推定的LaAP2蛋白分子量为37.74467kD,等电点为9.49.该蛋白氨基酸序列同亚麻荠、拟南芥、油菜等物种显示出较高同源性,系统进化分析结果表明与拟南芥亲缘关系较近.氨基酸序列分析预测表明,LaAP2基因所编码的蛋白不具备信号肽区段,无跨膜区,不属于分泌蛋白,可能为亲水性蛋白;定位于细胞质的可能性为56.5%,定位于细胞核的可能性为21.7%;其主要二级结构元件为无规则卷曲、延伸链、α-螺旋.Real0-timePCR分析独行菜幼苗中LaAP2在低温4℃处理下的表达,显示LaAP2表达受低温胁迫呈先下降后升高趋势.这表明LaAP2在独行菜幼苗抵抗低温胁迫中起调控作用.
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