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大菱鲆红体病虹彩病毒ATPase基因的克隆与序列分析

作者:史成银; 王印庚; 黄倢; 王清印虹彩病毒红体病大菱鲆序列分析克隆e基因传染性脾肾坏死病毒genbank腺苷三磷酸酶核苷酸序列多序列比对系统发育树功能蛋白分类地位编码区同源性代表性亚群鱼类

摘要:克隆了大菱鲆红体病虹彩病毒(TRBIV)的重要功能蛋白--腺苷三磷酸酶(adenosine triphosphatease, ATPase)基因的全部编码区及其上下游部分的核苷酸序列.经多序列比对和分析发现,TRBIV与GenBank中6种代表性虹彩病毒的同源性介于35%~98%之间.绘制出的包含TRBIV在内的14种虹彩病毒的系统发育树证实,TRBIV是一种新的鱼类虹彩病毒,其分类地位处在虹彩病毒科待指定病毒属内的真鲷虹彩病毒亚群和传染性脾肾坏死病毒亚群之间.

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