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核酸染料GeneGreen可影响DNA琼脂糖凝胶电泳条带的质量

作者:马强; 蔡燕; 徐磊; 廖何斌; 邹江; 孙茹; ...凝胶电泳溴化乙锭dna条带

摘要:目的探讨DNA琼脂糖凝胶电泳条带扭曲、"拖尾"的原因。方法采用"胶染法"和"后染法"2种方法,检测含2种核酸染料(GeneGreen和溴化乙锭)的琼脂糖凝胶中3种DNA Marker条带形态。结果采用"胶染法"的方式电泳,与相同浓度的溴化乙锭相比,含1∶10 000和1∶5 000 2种浓度的GeneGreen琼脂糖凝胶中3种DNA Marker条带呈现明显的扭曲和"拖尾"现象。而采用"后染法"的方式后,两种核酸染料所染的琼脂糖凝胶中3种Marker的条带均呈单一、无扭曲和"拖尾"现象。结论核酸染料GeneGreen可以影响琼脂糖凝胶电泳时DNA条带的质量。在排除DNA本身质量、琼脂糖凝胶质量、电泳液质量以及电压等因素后,若采用"胶染法"进行DNA核酸电泳时出现条带扭曲或"拖尾"时,应考虑到核酸染料质量的问题。采用"后染法"或更换核酸染料的种类可改善DNA电泳条带的质量。

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