作者:杨泽宁; 郑惠文; 李嘉祺; 李洪哲; 郭磊; ...人肠道病毒d型衣壳蛋白质类病毒非结构蛋白质类基因
摘要:目的 利用生物信息学的方法,探究不同亚型肠道病毒-D68型(EV-D68)的3C和3D非结构蛋白序列及结构是否存在差异.方法 通过将近年来世界各国EV-D68流行株(主要为中国株和美国株)的VP1核酸序列进行比对,利用邻接法(Neighbor-Joining)构建系统进化树进行分型,选取各型的代表株,利用其3C和3D蛋白的核酸序列构建进化树并同时利用其氨基酸序列进行同源建模,以进行蛋白质结构分析.结果 通过分析发现,EV-D68 Clade A、CladeB亚型毒株3D蛋白的三级结构均相同;而在3C蛋白的三级结构中,Clade B1亚型的毒株与Clade A、Clade B2和CladeB3亚型毒株存在差异.结论 3C蛋白的三级结构上的差异可能导致EV-D68 Clade B1亚型毒株的毒力和致病性高于Clade A、Clade B2和Clade B3亚型毒株.
注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社