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一种针对基因识别的GHMM简化算法

作者:李冬冬; 杜耀华; 王正志广义隐markov模型viterbi算法基因识别

摘要:广义隐Markov模型是计算机基因识别的一种重要模型,它克服了传统隐Markov模型的状态段长成几何分布的缺陷,更加适合于计算机基因识别.其缺点在于计算量大,需要采用有效的简化算法.利用基因的结构特点,在不附加额外限制条件的情况下,提出了一种新的简化算法,其计算复杂度是序列长度的线性函数.对实际生物序列数据的测试结果表明了此简化算法的有效性.

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国防科技大学学报

《国防科技大学学报》(CN:43-1067/T)是一本有较高学术价值的大型双月刊,自创刊以来,选题新奇而不失报道广度,服务大众而不失理论高度。颇受业界和广大读者的关注和好评。 《国防科技大学学报》主要刊登航天工程、材料科学与工程、数学与系统科学、物理学、化学工程与技术、机械工程、控制科学与工程、电子科学与技术、信息与通信工程、管理科学与工程、计算机科学与技术、光学工程等学科领域的有创新性的论文,有创造性、实用性的技术成果报告,重要学术问题评述等。

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