作者:仇永乐; 耿熙雪; 刘远航; 李昆珊; 郭杰口腔鳞状细胞癌长链非编码rna共表达网络节点基因
摘要:目的应用微阵列芯片技术检测长链非编码RNA(long non-codingRNA,lncRNA)在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)组织中的表达谱,筛选OSCC发病过程中节点lncRNA,研究其表达和临床意义。方法利用lncRNA表达谱芯片,对3例OSCC及对应正常组织的转录本进行高通量筛查,确定OSCC中的lncRNAs和mRNAs差异表达谱。利用lncRNA与mRNA特异性表达的标准化信号强度,构建差异基因共表达网络,挖掘节点基因,分析其表达水平与临床病理特征及患者预后之间的关系。选取部分差异表达的lncRNA,借助qRT-PCR技术对芯片结果进行验证。结果实验共筛选出差异表达lncRNAs2 294条和mRNAs 1 938条。LncRNA TMPRSS11BNL、lnc-WRN-10:1是共表达网络的节点基因,在OSCC组织中低表达,并与患者临床分期、淋巴结转移、远处转移和生存状态有关,低表达lncRNA TMPRSS11BNL、lnc-WRN-10:1 OSCC患者有着较短的无进展生存时间和总生存时间。qRT-PCR验证结果与芯片结果相一致。结论LncRNA TMPRSS11BNL、lnc-WRN-10:1有望成为成为OSCC早期诊断、治疗及预后评估的分子标志物。
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