作者：黄辉红 周元平 杨洁 曾艳丽 魏君锋 彭劼 ...丙型肝炎病毒基因型亚型系统进化树分析
摘要：目的扩增HCV种属信息区NS5B和高度保守区5＇-_UTR基因序列，用系统进化树法深入分析HCV基因型和亚型，阐明广东地区丙型肝炎患者HCV基因型和基因亚型的特点。方法采集99例慢性丙型肝炎病例血清，应用RT—PCR技术分别扩增HCVNs5B区和5’-UTR特定片段，测序后进行系统进化树分析，确定HCV基因型及亚型。结果99例患者标本均准确分型，其中NS5B区段分型74例，5’-UTR区段分型99例。HCV基因型和亚型的分布：1a亚型1例、1b亚型59例、1型7例、2a亚型11例、3a亚型3例、3b亚型2例、3型3例、6a亚型13例；另有2例标本在两区段分型不同，5’-UTR／NS5B区段分型分别为6a／1b和3a／lb。两区段共同分型74例，72例标本在两区段基因型一致，2例标本在两区段基因型不同，为HCV重组体。结论联合分析HCV不同区段基因序列，可提高HCV基因分型的准确度及灵敏性。广东地区慢性丙型肝炎患者HCV基因亚型分布以1b为主；其次为6a和2a；3型中的a-,b亚型也占有一定比例。
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