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转录组测序研究兰州百合抗冻关键基因及途径

作者:田雪慧; 郁继华; 颉建明兰州百合低温胁迫转录组测序差异基因抗冻基因通路分析分子机制

摘要:【目的】百合(Lilium)是国家卫生部首批公布的药食同源植物,也是著名的观赏植物。低温冻害严重影响植物的产量和分布,探究兰州百合对零下低温胁迫应答的分子机制。【方法】采用高通量IlluminaHiseq测序平台对兰州百合的20℃常温对照与-4℃寒冷处理(D)进行测序,并对测序数据进行分析研究。【结果】处理24h后检测到24465个差异表达的基因,筛选后获得4143个表达量上升的基因和4415个表达量下降的基因,占差异表达基因总数的10.27%。【结论】经富集分析认为,与蛋白激酶、蛋白磷酸酶、碳代谢以及ABA等相关的基因可作为研究兰州百合零下低温响应机制的主要研究对象。qRT-PCR分析表明,随机选出的10个差异性表达基因的表达趋势与高通量测序结果相一致。此外,吲哚-3-甘油磷酸合成酶、蛋白磷酸酶、已糖激酶、钙结合蛋白、叶绿素a/b结合蛋白等基因可作为与兰州百合寒冷响应相关的应答候选基因,为揭示兰州百合抗冻分子机制奠定了基础。

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广东农业科学

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