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金线兰黄酮相关基因的克隆与生物信息学分析

作者:陈莹; 潘王韵; 林思祖查尔酮合成酶黄酮醇合成酶基因克隆生物信息学

摘要:为了对金线兰查尔酮合成酶CHS和黄酮醇合成酶FLS进行基因的克隆和生物学信息分析,本研究参照测序得到的金线兰CHS与FLS基因的序列,设计特异性引物进行扩增。利用软件,对金线兰CHS和FLS蛋白的生物信息进行预测分析。结果显示,金线兰CHS基因的CDS总长度1 185 bp,编码394个氨基酸,金线兰FLS基因的CDS总长度1 035 bp,编码344个氨基酸。金线兰CHS蛋白与FLS蛋白皆是酸性、亲水性、无信号肽、非分泌、非跨膜蛋白,亚细胞定位在其他细胞器上,丝氨酸磷酸化位点具有调控二者构象变化的重要作用。在Blast上进行序列比对,发现金线兰CHS序列和FLS蛋白序列与一些兰科植物的相似度很高,前者序列同源性均高达85%以上,后者同源性高达82%和81%,构建的进化树显示了他们较近的亲缘关系。推测得到的CHS序列即为金线兰查尔酮合成酶的编码序列,FLS蛋白序列即为金线兰黄酮醇合成酶的编码序列。本研究为进一步研究金线兰中黄酮相关基因及其调控提供一定参考。

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分子植物育种

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