作者:张咏祀; 刘小红全长转录组序列分析ssr
摘要:水杉是中国著名的一级保护植物,为了充分开发和利用这一重要种质资源,本研究在水杉全长转录组测序的基础上,对水杉SSR(Simple sequence repeat)序列进行了详细序列分析。共发现SSR序列16227个,其中以单核苷酸为重复单位的最多,达到10290个,长度介于10~50 nt的为绝大部分,达到总数的96.1%,其余为51~315 nt,仅占3.9%。以二、三、四、五和六核苷酸为重复单位的SSR序列分别有1156、1789、25、11、54个,长度范围分别于介于12~58 nt、15~60 nt、20~44 nt、25~30 nt和30~36 nt。此外,还发现有2902个复杂SSR序列,长度介于21~4760 nt。该结果为水杉SSR分子标记开发和水杉基因资源的保护利用提供了分子依据。
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