作者:陶宏征; 高雪; 贾志强; 刘雅婷nss朱顶红褪绿环斑病毒结构功能生物信息学
摘要:朱顶红褪绿环斑病毒(Hippeastrum chlorotic ringspot virus,HCRV)是番茄斑萎病毒属(Orthotospovirus)新病毒,其流行及扩张速度极快。NSs蛋白是HCRV编码的非结构蛋白,在Orthotospovirus其他病毒中,NSs蛋白被证明在病毒侵染寄主的过程中发挥重要作用,但在HCRV中,NSs功能尚不明确。本研究分析和预测了HCRV的性质和功能,结果表明:26种Orthotospovirus属病毒的NSs蛋白氨基酸序列相似性不高,在进化过程中保守性较低;HCRV NSs蛋白是酸性稳定的亲水蛋白,无信号肽,可能具有一段跨膜区域,属于Bunya_NSs-2超家族。该蛋白二级结构以无规则卷曲为主,功能预测显示该蛋白可能具有磷酸化酶作用,并且可能与物质在寄主体内的运动相关。本研究结果为进一步研究NSs的作用机制以及分析HCRV的快速流行原因提供一定的参考。
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