作者：张博; 李燕玲; 张金兰; 黄东益; 吴文嫱; ...microrna靶基因基因表达
摘要：参薯(Dioscorea alata),其地下块茎富含淀粉、多糖、蛋白质等多种营养物质,是热带和亚热带地区重要的主食之一,同时也是药物和生物质能源的原料。由于可获得的序列非常有限,参薯分子水平研究非常薄弱。在本研究中,我们以现有的参薯基因组序列和表达序列为基础,使用生物信息学的方法,挖掘参薯序列中的microRNA基因,并对这些基因的表达特征进行分析。根据miRBase数据库中公布的成熟miRNA序列和参薯基因组,预测属于参薯miR159、miR164、miR167和miR168家族的miRNA基因13个。于此同时,我们根据参薯的表达序列,预测了这些家族的靶基因共17个,并对靶基因进行了功能注释。之后,我们使用RT-PCR检测13个miRNA在参薯叶片、缠绕茎、块茎等多个组织的表达,找到了5个miRNA基因在块茎中表达,有可能块茎发育相关。本研究为进一步探索miRNA在参薯块茎发育中的功能,为构建miRNA调控块茎发育网络提供信息,为改良参薯薯型提供帮助。
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