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玉米DNA去甲基化酶ROS1生物信息学及盐胁迫下表达分析

作者:孙丽芳; 胡凯凤; 邓杰; 苗兴芬; 常国伟; ...玉米dna去甲基化ros1生物信息学盐胁迫

摘要:利用同源序列法,本实验以拟南芥DNA去甲基化酶ROS1的序列成功在玉米Maize Sequence网站获得玉米同源序列,并利用生物信息学的方法对其序列进行预测分析。显示,玉米ROS1包括3个拷贝,且同源性比较接近,酸性不稳定的可溶性亲水蛋白,不含信号序列,均具有DNA-glycosylase,Hh H-GPD-domain,HTH-base-excis_C及RRM-DME结构域,但是ROS1-3不具有Perm-CXXC结构域,系统进化分析发现与单子叶植物谷子、小麦和高粱关系较近。为进一步分析其功能,本实验以盐胁迫下耐盐玉米自交系为材料,Realtime q RT-PCR定量检测该酶DNA-glycosylase功能结构域表达水平。发现,盐浓度为200 mmol/L时表达量最高,与对照相比差异显著。该实验说明玉米ROS1去甲基化酶可能参与逆境胁迫下玉米的甲基化调控机制。

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分子植物育种

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