作者：白戈 姚恒 杨大海烟草dna甲基化argonaute基因序列分析
摘要：DNA甲基化是一种重要的遗传修饰现象,植物中DNA甲基化主要是通过RNA介导的甲基化路径(RNA direct DNA methylation,Rd DM)而建立。其中ARGONAUTE 4(AGO4)和ARGONAUTE 6(AGO6)基因是该路径中重要的功能基因,它们能够结合24 nt的si RNA,目前烟草(Nicotiana tabacum L)中尚无这2个基因的报道。本文根据拟南芥(Arabidopsis thaliana)At AGO4及At AGO6的蛋白序列,通过同源比对烟草基因组数据库鉴定出烟草7个Nt AGO4及2个Nt AGO6候选基因。根据烟草基因组测序和转录组测序数据,预测了烟草Nt AGO4及Nt AGO6基因结构,结果表明候选基因具有相似的基因结构,均具有PIWI保守结构域。采用MEGA 6.0软件构建进化树,发现栽培烟草具有Nt AGO4及Nt AGO6候选基因。目前关于烟草基因信息的研究比较少,本研究丰富了对烟草AGO4及AGO6基因的认识。
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