作者：闫双勇; 谭振波; 刘学军; 苏京平; 马忠友...snp抽穗期多态性分析候选基因侯选基因数据库搜索多态性位点农艺性状控制机理水稻基因控制基因调控途径热点光周期拟南芥820分析表分布编码区遗传花期
摘要：抽穗期是水稻的一种重要农艺性状,但其遗传控制机理还不清楚.本文利用数据库搜索的方法,搜索并分析了30个与拟南芥光周期调控途径花期控制基因同源的水稻基因.利用水稻多态性数据库,得到了发生在这些基因以及Hd6、Ehd1、OsSOC1上的820个SNP及191个InDel位点.分析表明,这些位点不是平均分布到每个基因上.SNP/InDel含量较高的基因存在SNP/InDel的热点片段.14.1%的SNP位点,及7%的InDel位点分布在基因的编码区.本文也分析了侯选基因侧翼5Kb范围内的SNP/InDel多态性位点.按照侧翼多态性位点数目的分布可以将侯选基因分成4种类型,即两侧保守型、两侧热点型、单侧热点型、一侧热点一侧保守型.
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