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REPLI-g^■Single Cell Kit应用于微量DNA扩增的效率评估

作者:徐倩南; 沈琼; 张佳怡; 张轶伦; 李莉; 刘...法医遗传学短串联重复全基因组扩增多重置换扩增微量检材

摘要:目的评估REPLI-g^■Single Cell Kit应用于检材DNA扩增的效率,探讨该试剂盒在法医学微量DNA扩增方面的应用价值。方法选取3种微量DNA提取试剂盒,对来自10名无关个体的外周血进行DNA提取,并对所提DNA的产量和纯度进行比较。根据比较结果选取1例DNA样本进行浓缩稀释作为全基因组扩增起始样本,使用REPLI-g^■Single Cell Kit对起始样本进行全基因组扩增,计算扩增产量及扩增倍数,并进行琼脂糖凝胶电泳检测片段分布情况。使用Goldeneye^■DNA身份鉴定系统20A对起始样本和经全基因组扩增所得DNA进行STR分型。结果经比较后选取由QIAsymphony^■DNA Investigator^■Kit所提取的1例DNA进行浓缩稀释作为全基因组扩增起始样本。经REPLI-g^■Single CellKit对一系列起始样本全基因组扩增后,发现扩增产量均值最低可达到8.77×10^3ng,相应的扩增倍数均值为1.40×10^6,DN段大且集中。全基因组扩增样本随着起始样本量的减少,STR分型成功率降低,但当起始样本量低于0.5ng时,全基因组扩增后样本的STR分型成功率高于相同起始量未经全基因组扩增样本的STR分型成功率。结论应用REPLI-g^■Single Cell Kit可有效提高模板DNA总量,特别对于微量DNA,可在一定程度上提高STR分型成功率。

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法医学

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