作者：郑乃仁; 单亦初; 邓玉林; 张玉奎蛋白质组学等重标记蛋白质鉴定
摘要：等质量肽段末端标记（Isobaric peptide termini labeling,IPTL）是一种使用轻、重同位素分别对肽段的C端和N端进行等重标记的技术。在对使用这种标记技术得到的数据进行一级谱分析时,由于肽段的质量相同,不会增加样本的复杂性,而在处理二级谱的数据时,可利用成对的b、y离子进行分析。本研究利用IPTL方法得到的实验数据设计了一种新的打分算法：全部离子打分算法（All ions scoring algorithm,AISA）。AISA在对数据进行处理时,可以同时得到定性和定量信息。在Q-Exactive He La和Human-HCC-HL数据集上的蛋白定量覆盖率分别达到99%和100%。在Q-Exactive He La 2D RPLC数据集上,AISA算法鉴定到的PSM、唯一肽段和蛋白质分别比Morpheus高15%、26%和22%。在Human-HCC-HL数据集上,AISA算法鉴定到的PSM、唯一肽段和蛋白质分别比Morpheus高24%、39%和27%。在Q-Exactive He La和Human-HCC-HL数据集上蛋白质定量比值的平均值非常接近1,分别为1.18和0.90;在0.5~2.0区间内的定量比值分别为91%和94%。
注：因版权方要求，不能公开全文，如需全文，请咨询杂志社
