作者：瘳之君 马文丽 梁爽 刘华 张海燕 陈数珍 ...荧光成纤维细胞辐射电离芯片分析技术自动数据处理
摘要：目的探讨荧光染料交换标记设计的基因芯片数据挖掘方法，并对低剂量电离辐射影响人成纤维细胞基因表达谱数据进行分析。方法应用GeneSifter在线软件和Panther生物学信息数据库，对下载于NCBI的GEO数据库的8个样品GSM（包含4个时间点），选择正确的参数设置上载数据，运用ANOVA方法进行数据挖掘，并对差异表达基因进行功能归类分析。结果获得203条差异表达基因，合并相同基因名后为176条基因。双向聚类和主成分分析发现，样品的24h时间点基因表达谱与前3个时间点有显著差异，功能归类分析提示，多个生物通路如细胞周期、核酸代谢、DNA代谢等被显著激活。结论应用这种方法可以挖掘荧光交换标记的微阵列数据，低剂量电离辐射对人成纤维细胞基因表达有时间累积效应，可能引起DNA损伤、细胞周期阻滞等变化，诱导细胞凋亡。
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