作者：邹毅辉; 刘昌勇; 林泽燕; 李珍半枝莲转录组测序差异表达黄酮生物合成
摘要：半枝莲为我国传统中药,具有重要的经济价值,但分子基础研究滞后,在一定程度上限制了其资源利用与开发。本研究利用Illumina HiSeq X Ten技术平台对半枝莲进行了转录组测序,通过denovo组装,获得125823个unigene,N50长度826bp、平均长度586bp,并有74185个unigene得到注释。半枝莲地上部分对地下部分差异表达unigene有14832个,其中上调表达6941个,下调表达7891个;推测差异unigene多集中于植物-病原菌互作、淀粉和蔗糖代谢以及苯丙素生物合成等代谢途径。利用KEGG数据库挖掘出89个半枝莲黄酮类生物合成途径相关unigene,其中差异表达unigene36个。半枝莲地上部分与地下部分差异基因分析中,黄酮类化合物合成途径的重要酶都有明显的下调表达,推测半枝莲的黄酮类化合物合成器官是地上部分,其主要的药用部位是茎叶。黄酮类的关键酶研究结果为半枝莲分子生物学研究奠定基础,为半枝莲药用活性成分的生物合成调控、品质改良、品种选育等提供参考依据。
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