胁迫中华蜜蜂幼虫肠道的球囊菌及其体外培养的高表达基因分析

作者：陈大福; 王鸿权; 李汶东; 熊翠玲; 郑燕珍...中华蜜蜂球囊菌高表达基因

摘要：利用RNA-seq技术对胁迫中华蜜蜂（简称中蜂）6日龄幼虫肠道的球囊菌及其体外培养进行深度测序,根据基因的FPKM值筛选得到高表达基因（HEGs）,进而对HEGs进行GO及KEGG代谢通路（pathway）富集分析.Illumina测序数据经质控和过滤得到100814558条有效读段（clean reads）,平均Q30均在93.81%以上.GO富集分析结果显示处理组（Aac T）的HEGs富集于39个GO term,基因富集数最多的是细胞（1872 unigene）、细胞组件（1872 unigene）和细胞进程（1748 unigenes）;对照组（Aa CK）的HEGs富集于37个GO term,基因富集数最多的是细胞（785 unigenes）,其次是细胞组件（785 unigenes）和代谢进程（776 unigenes）.KEGG pathway富集分析显示,Aac T的HEGs富集在119个代谢通路上,基因富集数最多的是核糖体（176 unigenes）、碳代谢（147 unigenes）及氨基酸的生物合成（134 unigenes）;Aa CK的HEGs富集在110个代谢通路上,基因富集数最多的是核糖体（179 unigenes）、氨基酸的生物合成（70 unigenes）以及碳代谢（62 unigenes）.深入分析发现,对于富集在MAPK信号通路上的高表达基因数量,胁迫中蜂幼虫肠道的球囊菌远多于体外培养的球囊菌,说明病原的该通路在胁迫后期被显著激活.

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