小西葫芦黄花叶病毒辽宁分离物的鉴定与序列分析

作者：付晶晶; 杨彩霞; 韩彤; 廖一鸣; 李梁; 李...小西葫芦黄花叶病毒辽宁分离物序列分析

摘要：从辽宁省沈阳市和盖州市分别采集表现花叶的南瓜样品,经透射电镜负染色实验,观察到典型的马铃薯Y病毒属（Potyvirus）线状病毒粒子.利用Potyvirus通用引物Legpoty F/LegpotyR分别对3个沈阳样品和3个盖州样品进行RT-PCR扩增,得到预期片段,克隆并测序.Blast显示6个病毒样本与小西葫芦黄花叶病毒（ZYMV）同源性最高,均大于99%.利用已经报道的特异引物ZYMV-F/ZYMV-R,从6个样本中扩增到约1.2 kb的ZYMV片段,片段包含完整的外壳蛋白（CP）基因.基于CP的核苷酸序列同源性分析,发现2个ZYMV辽宁分离物与山西分离物ZYMV-[CN：SX：Chrysanthemum：14]（KP742962）同源性最高,达99.1%和99.4%.系统进化树分析表明,2个ZYMV辽宁分离物与山西分离物ZYMV-[CN：SX：Chrysanthemum：14]聚集在一个分支,推测ZYMV辽宁分离物与山西分离物亲缘关系最近.

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